Σε περιπτώσεις που λαμβάνετε παραστατικό με μειωμένο συντελεστή ΦΠΑ λόγω γεωγραφικής περιοχής και έχει ποσό με άρθρο απαλλαγής το 39α, θα πρέπει στη λογιστική καταχώρηση εξόδου, για το ποσό που αφορά τη συναλλαγή 39α και την ορθή χρεωπίστωση του ΦΠΑ να χρησιμοποιηθεί λογαριασμός με τον ίδιο συντελεστή ΦΠΑ (πχ 17%). 

Παραδείγματος χάρη, παραστατικό με 2 γραμμές σύνοψης από τον Προμηθευτή, η 1η γραμμή με φορολογητέα αξία και συντελεστή 17%, η 2η άνευ ΦΠΑ με άρθρο απαλλαγής 39α.

Σε περίπτωση που στη λογιστική καταχώρηση χρησιμοποιηθεί για το ποσό που αφορά το 39α λογαριασμός με 24%, τότε στην προσπάθεια χαρακτηρισμού θα εμφανιστεί σφάλμα XML Syntax Error, καθώς θα υπάρξει λανθασμένο ποσό χαρακτηρισμού ΦΠΑ σύμφωνα με την παρακάτω εικόνα:

Συνεπώς, στη λογιστική καταχώρηση, αλλάζοντας τον λογαριασμό για το 39α ώστε να έχει ίδιο συντελεστή με την 1η γραμμή (δηλαδή 17%), ολοκληρώνεται επιτυχώς ο χαρακτηρισμός.