Υπάρχουν τρεις διαθέσιμοι τρόποι υπολογισμού του Φ.Μ.Υ. Ο χρήστη ορίζει   στην καρτέλα 5.Μισθοδοτικά στο πεδίο Φ.Μ.Υ.: Τρόπος έναν από τους παρακάτω:

• Κανονικός
• Προοδευτικός
• Συντελεστής

Κανονικός Τρόπος

Ο κανονικός τρόπος υπολογισμού προτείνεται να επιλέγεται ως μέθοδο υπολογισμού για εργαζόμενους που δεν έχουν πρόσληψη από τις αρχές του έτους, καθώς δεν υφίσταται οι 14 περίοδοι υπολογισμού.
Επιπλέον, μπορεί να επιλεχθεί  ως τρόπος υπολογισμού του φόρου και για εργαζόμενο με  ημερομηνία πρόσληψης προγενέστερη της τρέχουσας χρήσης.
Στην 2η περίπτωση εάν ο χρήστης επιθυμεί να προβεί σε εκκαθάριση του ετήσιου υπολογιζόμενου φόρου προτείνεται να πραγματοποιήσει αλλαγή του  τρόπου υπολογισμού του φμυ απο Κανονικό σε Προοδευτικό στην τελευταία μισθοδοτική περίοδο (Δεκέμβριος)

Με τον κανονικό τρόπο ο υπολογισμός του φόρου που ακολουθείται στην εφαρμογή της μισθοδοσίας είναι ο παρακάτω:

• (Μεικτά Περιόδου – Ασφαλιστικές Κρατήσεις Εργαζομένου) *14 περίοδοι υπολογισμού = Φορολογητεό ποσό
• Το φορολογητέο ποσό συμμετέχει στη κλίμακα του φόρου κλιμακωτά (Ν.4172/2013 (ΦΕΚ Α΄ 167-23.07.2013)
• Έπειτα εφαρμόζεται η μείωση φορου και το εναπομείναν ποσό διαρείται με τις 14 περιόδους υπολογισμού για να βρεθεί ο μηνιαίος φόρος.

Ενδεικτικό Παράδειγμα: Εργαζόμενος με μισθό 1.100,00 ευρώ, κρατήσεις περιόδου εργαζόμενου 147,07, χωρίς τέκνα

(1.100,00-147,07)*14=952,93*14=13.341,02
Απο το ποσό των 13.341,02 οι 10.000,00 φορολογούνται με συντελεστή 9% και οι υπολοπές 3.341,02 με συντελεστή 22%.Επομένως, ο προκύπτων φόρος είναι ο παρακάτω 900+735,02=1.635,02
Εφαρμόζεται η μείωση του φόρου κλιμακώτα ακολουθώντας την παρακάτω πράξη:
13.341,02 – 13.000,00=341,02    (341,02/1.000)*20=6,82
Για τις 13.000 η μείωση φόρου για εργαζόμενο χωρίς τέκνα είναι 757. Αρα,  για τις 13.341,02 η αναλογική μείωση του φόρου είναι 757 – 6,82=750,18
Ο  προκύπτων φόρος μετά την αναλογική μείωση είναι 1.635,02-750,18=884,84.Εντέλει ο μηνιαίος φόρος είναι 884,84/14=63,20

Προοδευτικός Τρόπος

Ο προοδευτικός τρόπος υπολογισμού προτείνεται ως μέθοδο υπολογισμού όταν ο εργαζόμενος έχει πρόσληψη στις αρχές του έτους.Με τον εν λόγω τρόπο υπολογισμού ο φόρος εκκαθαρίζεται μηνιαίως.

Με τον προοδευτικό τρόπο ο υπολογισμός του φόρου που ακολουθείται στην εφαρμογή της μισθοδοσίας είναι ο παρακάτω:

• (Μεικτά Περιόδου – Ασφαλιστικές Κρατήσεις Εργαζομένου) *Χ περίοδοι υπολογισμού = Φορολογητεό ποσό
• Το φορολογητέο ποσό συμμετέχει στη κλίμακα του φόρου κλιμακωτά (Ν.4172/2013 (ΦΕΚ Α΄ 167-23.07.2013)
• Έπειτα εφαρμόζεται η μείωση του φορου, αφαιρείται το ποσό του φόρου που παρακρατήθηκε ήδη και το υπολειπόμενο ποσό διαρείται με τις εναπομείναντες περιόδους υπολογισμού προκειμένου να βρεθεί ο μηνιαίος φόρος.

Ενδεικτικό Παράδειγμα: Εργαζόμενος με μισθό 1.100,00 ευρώ, ομάδα ταμείου 101 ικα μικτα εταμ έχει αύξηση μισθού στα 1.250,00 απο τον 02/2025.

Για να υπολογισούμε τον φόρου του 02/2025 ακολουθούμε την παρακάτω διαδικασία

1.250,00-167,13=1.082,87   1.082,87*13 εναπομείνατες μήνες + καθαρό ποσό του Ιανουαρίου 952.93=15.030,24
Απο το ποσό των 15.030,24 οι 10.000 φορολογούνται με συντελεστή 9% και οι υπολοιπες 5.030,24 με συντελεστή 22%.Επομένως, ο προκύπτων φόρος είναι ο παρακάτω 900+1.106,65=2.006,65
Εφαρμόζεται η μείωση του φόρου κλιμακώτα ακολουθώντας την παρακάτω πράξη:
15.030,24-15.000=30,24  30,24/1000*20=0,60
Για τις 15.000 η μείωση του φόρου είναι 717, οπότε για τις 15.030,24 η αναλογική μειώση του φόρου ειναι 717-0,60=716,40.
Ο προκύπτων συνολικός φόρος μετά την αναλογική μειώση ειναι 2.006,65-716,40=1.290,25. Έπειτα, αφαιρείται το ποσό του φόρου που παρακρατήθηκε τον Ιανουάριο 1.290,95-63,20=1.227,05 και διαρείται το ποσό με τους εναπομείναντες μήνες 1.227,05/13=94,39

Συντελεστής

Ο συντελεστής χρησιμοποιείται ως μέθοδος υπολογισμού του φόρου σε ειδικές περιπτώσεις πχ σε εργαζόμενους ημερομίσθιους ορισμένου χρόνου με απασχόληση μικρότερη του έτους.

Με τον συντελεστή  ο υπολογισμός του φόρου που ακολουθείται στην εφαρμογή της μισθοδοσίας είναι ο παρακάτω:

(Μεικτά περιόδου  – Κρατήσεις Εργαζομένου )* τον αντίστοιχο συντελεστή